初期症状が軽くて発見が遅れやすい病気です。男性の場合、尿道炎の症状が出ますが、痛みや不快感がそれほど強くはありません。女性の場合は、子宮頸管炎ですが、自覚症状がほとんどありません。おりものが普段より多い程度です。この感染症は放置されることによってさまざまな合併症を引き起こします。男性は副睾丸炎、前立腺炎、精路閉塞による不妊、ライター症候群、女性では、卵管炎、子宮頚管炎、骨盤内感染による不妊、新生児への垂直感染が問題になります。